اخذ پذیرش مقاله دکتر حمیدرضا قربانی در مجله پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی

اخذ پذیرش مقاله دکتر حمیدرضا قربانی در مجله پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی- دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مقاله با موضوع اصلاح گیاهان زراعی تحت عنوان: تجزیه بیوانفورماتیکی پروتئین های حاوی دُمین ARID-PHD و بررسی بیان ژن آن تحت تنش شوری در گیاه هالوفیت  Aeluropus littoralis

اخذ پذیرش مقاله دکتر حمیدرضا قربانی مدرس آموزشکده کشاورزی ساری در مجله پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی- دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

این مقاله با موضوع اصلاح گیاهان زراعی تحت عنوان : تجزیه بیوانفورماتیکی پروتئین های حاوی دُمین ARID-PHD  و بررسی بیان ژن آن تحت تنش شوری در گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis  به نگارش درآمده است.

چکیده

تنش­های غیرزیستی از مهمترین عوامل محدود کننده عملکرد گیاهان زراعی محسوب می­شوند. تحلیل داده­های زیستی به واسطه علم بیوانفورماتیک، نقش مهمی در بررسی ژن­ها، ارتباطات و نیز پیشگویی کارکرد آن­ها در پاسخ به تنش­های غیرزیستی دارد. پروتئین­های دارای دُمین ARID-PHD در گیاهان و جانوران شناسایی شده و نقش بسیار مهمی در تنظیم رشد، چرخه سلولی و بیان ژن­های اختصاصی هر بافت دارند. در این تحقیق، توالی مربوط به ناحیه محافظت شده دُمین ARID در پایگاه­های اطلاعاتی مختلف همچون NCBI در برابر توالی های ثبت شده برای گیاهان مختلف جستجو و در نتیجه آن 10 پروتئین گیاهی حاوی دُمین ARID-PHD یافت شد. گیاهان شامل آرابیدوپسیس، آجیلوپس، براکیپودیوم، سویا، برنج وحشی، برنج ژاپونیکا، ارزن دم روباهی، سورگوم، ذرت و آلوروپوس بود. همردیف سازی توالی­ها، رسم درخت فیلوژنتیکی، بررسی ویژگی­های پروتئینی و الگوی بیان نسبی ژن ARID در گیاه شوری­زی آلوروپوس انجام گرفت. نتایج نشان داد که علاوه بر شباهت توالی­های اسید آمینه، پروتئین­ها نیز به دو گروه گیاهان تک لپه و دو لپه تقسیم شدند. بررسی ساختار و ویژگی پروتئین­ها بیانگر درجه حفاظت بالای پروتئین در گیاهان مختلف بود. بررسی میزان بیان ژن در گیاه آلوروپوس نشان داد که حداکثر تعداد رونوشت­های ژن در اندام هوایی گیاه بوده و این افزایش معنی­دار  بعد از 6 ساعت از اعمال تنش شوری در حداکثر مقدار بوده و تا 24 ساعت بعد از تنش نیز کاهش معنی­داری نشان نداد که بیانگر نقش احتمالی این پروتئین در تحمل گیاه به تنش می­باشد. در بافت ریشه گیاه، میزان بیان ژن نسبت به تیمار شاهد کاهش یافت. به طور کلی، این مطالعه اولین گزارش در مورد بررسی ویژگی توالی پروتئینی و تغییرات بیان ژن ARID در گیاه هالوفیت آلوروپوس در شرایط تنش بوده و می­تواند به عنوان گام ابتدایی در استفاده از این خانواده ژنی به منظور اصلاح و دست­ورزی گیاهان در جهت تحمل به تنش­های غیرزیستی به ویژه شوری باشد.